基礎生物資訊實務BASIC BIOINFORMATICS PRACTICE 2/E (附CD) (2版)

基礎生物資訊實務（第二版） ISBN13：9789576168178 出版社：藝軒 作者：李炎 裝訂：平裝 出版日：2005/04/02 中國圖書分類：生命科學 本書主要以分子生物學的觀念，介紹如何利用網路上免費的生物資訊工具。舉凡如何將片段DNA查出它的可能蛋白質為何？此蛋白質的可能3D結構為何？或是它是否含有“表現段-exon”或“插入段intron”？有否含tRNA、mRNA或rRNA片段？幾個片段的胺基酸排序之間有否演化上的關連性？並繪出演化樹。若人類到外太空取得一段蛋白質樣本，能否由地球上的資料庫中比對出其可能的功能？人類基因解碼對我們有何意義？如何去運用此資料庫等等。並提供如何利用免費資源協助設計PCR的引子，繪質體圖、家譜圖，及限制切割點的預測。並附有趣味性的操作練習，有如在電腦遊戲而能學習。 本書絕對是大學中生物、生命科學、生技等科系同學或有志於此的高中職同學不可或缺的參考書。 目錄 前　言 何謂生物資訊（What is Bioinformatics）？2 第1章資料蒐集 國家圖書館資料庫整合查詢10 國科會科資中心10 美國國家醫學圖書館13 全文檢索資料庫14 下載格式14 論文參考資料格式15 第2章分子生物學重點提要 生物分類18 生命操控機制18 DNA與RNA的結構24 蛋白質的合成27 基因運作控制32 基因調控組（Operon）33 真核細胞基因調控37 生物技術40 第3章生物資訊工具 生物資訊工具查察範圍48 結構資料庫（可查圖樣）50 應用工具性質的資料庫51 功能分析工具51 回饋提供資料52 其它輔助工具54 生資工具相互關係55 第4章片段校對搜尋基礎工具（BLAST）的使用 BLAST的功用58 查詢資料輸入方式59 指定要查的資料範圍60 BLAST查詢示例61 序列差異的百分比與演化距離的關係63 結果所代表的意義64 比較2段DNA或胺基酸排序之異同70 2段以上DNA或胺基酸排序之比較70 BLAST類似功能工具網站73 第5章生物分子2級與3D結構軟體之應用 查DNA或RNA與蛋白質之複合結構85 查蛋白質2級結構87 蛋白質分子量推算91 核酸與蛋白質3D動態模型資料庫92 第6章人類基因體的解碼定序（sequencing）與組合（assembly） 人類染色體的結構98 人類基因體的解碼定序99 人類基因體解碼樣本100 解碼方式101 人類基因體組合與標記原理簡述105 人類基因體關聯性輿圖的建立106 組合與標記基本方法110 DNA片段組合實例110 基因體物理輿圖的建立114 影響繪成基因輿圖的因素118 基因輿圖正確性如何119 人類基因體標記的目的120 第7章人類基因體蛋白質基因標記應用 人類蛋白質基因的結構132 常用人類蛋白質基因標記軟體135 電腦軟體比對的可能結果142 人類基因體標記步驟143 第8章人類基因庫之應用 人類基因體解碼定序的重要發現174 人類染色體基因輿圖179 查詢與疾病有關基因182 癌症基因資料庫184 查詢人類est資料庫186 免疫有關基因庫187 單1核酸多樣性（Single Nucleotide Polymor- phisms-SNPs）資料查詢188 第9章生物資訊有關演化、分類工具之應用 193 第10章合成鏈索反應生物資訊工具之應用 PCR在生物技術應用實例-大腸桿菌「質體載體」製作221 標的基因排序前後黏接尾如何形成232 第11章基因分析工具 查真核生物之促進子排序244 搜詢操作子（operator）片段或增強子（enhancer） 片段245 搜詢已知之細菌與　無關之轉錄終止片段資料246 搜詢tRNA247 搜尋siRNA（small interfering RNA）247 查已知排序生物之5SRNA序列249 查詢基因在（人體）不同組織細胞中的表現情形251 分析蛋白質的胺基酸比率、重覆片段、電價狀況與分 佈等253 分析限制切割片段253 蛋白質功能、特性、在生化反應途徑的作用等256 將胺基酸排序改為DNA排序258 細菌基因組整體比較260 老鼠基因分析網262 查詢質體排序264 查詢原核生物基因調控組265 基因晶片工具266 第12章生物、生化、細胞、遺傳、生統教學工具 各種微生物顯微圖譜272 人體結構（解剖、生理）272 分子生物、微生物、細胞學及遺傳學圖解教學網274 分子生物、細胞學及遺傳學等實驗之步驟（包括各種溶 液配方）279 遺傳工程技術282 常用化學分子資料庫282 單糖類3D結構網283 遺傳學教學資源網284 各種生物分解化合物的代謝途徑資料284 孟氏遺傳學基礎測驗題及解答285 遺傳圖譜繪圖工具285 質體繪圖工具286 藍細菌相關資料288 想在網上投稿有關生命科學的期刊嗎288 生物統計應用軟體289 面對決擇301